Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.9 ms