Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nfe2Q07279 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms