Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms