Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms