Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top1Q04750 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top1Q04750 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top1Q04750 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top1Q04750 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top1Q04750 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Top1Q04750 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Top1Q04750 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms