Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms