Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms