Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms