Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms