Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms