Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms