Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms