Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SelpQ01102 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SelpQ01102 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SelpQ01102 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SelpQ01102 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SelpQ01102 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SelpQ01102 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SelpQ01102 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SelpQ01102 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SelpQ01102 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms