Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms