Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms