Protein–RNA interactions for Protein: Q00560

Il6st, Interleukin-6 receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il6stQ00560 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Il6stQ00560 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Il6stQ00560 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Il6stQ00560 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Il6stQ00560 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Il6stQ00560 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Il6stQ00560 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Il6stQ00560 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Il6stQ00560 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Il6stQ00560 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Il6stQ00560 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Il6stQ00560 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Il6stQ00560 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Il6stQ00560 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Il6stQ00560 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Il6stQ00560 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Il6stQ00560 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Il6stQ00560 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Il6stQ00560 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Il6stQ00560 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Il6stQ00560 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Il6stQ00560 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Il6stQ00560 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Il6stQ00560 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Il6stQ00560 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Il6stQ00560 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Il6stQ00560 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Il6stQ00560 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Il6stQ00560 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Il6stQ00560 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Il6stQ00560 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Il6stQ00560 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Il6stQ00560 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Il6stQ00560 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Il6stQ00560 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Il6stQ00560 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Il6stQ00560 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Il6stQ00560 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Il6stQ00560 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Il6stQ00560 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Il6stQ00560 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Il6stQ00560 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Il6stQ00560 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Il6stQ00560 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Il6stQ00560 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Il6stQ00560 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Il6stQ00560 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Il6stQ00560 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Il6stQ00560 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Il6stQ00560 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Il6stQ00560 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Il6stQ00560 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Il6stQ00560 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Il6stQ00560 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Il6stQ00560 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Il6stQ00560 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Il6stQ00560 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Il6stQ00560 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Il6stQ00560 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Il6stQ00560 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Il6stQ00560 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Il6stQ00560 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Il6stQ00560 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Il6stQ00560 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Il6stQ00560 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Il6stQ00560 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Il6stQ00560 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Il6stQ00560 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Il6stQ00560 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Il6stQ00560 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Il6stQ00560 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Il6stQ00560 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Il6stQ00560 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Il6stQ00560 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Il6stQ00560 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Il6stQ00560 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Il6stQ00560 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Il6stQ00560 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Il6stQ00560 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Il6stQ00560 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Il6stQ00560 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Il6stQ00560 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Il6stQ00560 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Il6stQ00560 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Il6stQ00560 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Il6stQ00560 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Il6stQ00560 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Il6stQ00560 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Il6stQ00560 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Il6stQ00560 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Il6stQ00560 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Il6stQ00560 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Il6stQ00560 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Il6stQ00560 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Il6stQ00560 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Il6stQ00560 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Il6stQ00560 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Il6stQ00560 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Il6stQ00560 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Il6stQ00560 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms