Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms