Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn1bP97952 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn1bP97952 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn1bP97952 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn1bP97952 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn1bP97952 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn1bP97952 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn1bP97952 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn1bP97952 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn1bP97952 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn1bP97952 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn1bP97952 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn1bP97952 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn1bP97952 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn1bP97952 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn1bP97952 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn1bP97952 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn1bP97952 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn1bP97952 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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