Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms