Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bop1P97452 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Bop1P97452 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bop1P97452 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bop1P97452 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bop1P97452 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bop1P97452 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bop1P97452 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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