Protein–RNA interactions for Protein: P97390

Vps45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps45P97390 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps45P97390 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps45P97390 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps45P97390 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps45P97390 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps45P97390 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps45P97390 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps45P97390 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps45P97390 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms