Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms