Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mesp1P97309 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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