Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcgP82348 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcgP82348 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcgP82348 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcgP82348 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms