Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx3P81067 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx3P81067 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx3P81067 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx3P81067 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx3P81067 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx3P81067 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx3P81067 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx3P81067 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx3P81067 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx3P81067 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms