Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irx2P81066 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Irx2P81066 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Irx2P81066 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx2P81066 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx2P81066 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx2P81066 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms