Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx2P80206 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx2P80206 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx2P80206 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx2P80206 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Otx2P80206 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Otx2P80206 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Otx2P80206 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Otx2P80206 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Otx2P80206 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Otx2P80206 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms