Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SeboxP70368 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeboxP70368 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeboxP70368 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeboxP70368 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeboxP70368 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeboxP70368 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeboxP70368 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeboxP70368 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SeboxP70368 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeboxP70368 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeboxP70368 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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