Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx3P70354 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msx3P70354 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msx3P70354 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx3P70354 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx3P70354 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Msx3P70354 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Msx3P70354 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Msx3P70354 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms