Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms