Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Chl1P70232 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Chl1P70232 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chl1P70232 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chl1P70232 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chl1P70232 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chl1P70232 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Chl1P70232 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chl1P70232 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Chl1P70232 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Chl1P70232 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chl1P70232 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Chl1P70232 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms