Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SbdsP70122 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbdsP70122 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbdsP70122 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbdsP70122 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SbdsP70122 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbdsP70122 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbdsP70122 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms