Protein–RNA interactions for Protein: P62821

Rab1A, Ras-related protein Rab-1A, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1AP62821 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rab1AP62821 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab1AP62821 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab1AP62821 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab1AP62821 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab1AP62821 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab1AP62821 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab1AP62821 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab1AP62821 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab1AP62821 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab1AP62821 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab1AP62821 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab1AP62821 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab1AP62821 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab1AP62821 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab1AP62821 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab1AP62821 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab1AP62821 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab1AP62821 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab1AP62821 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab1AP62821 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab1AP62821 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab1AP62821 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab1AP62821 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab1AP62821 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab1AP62821 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab1AP62821 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab1AP62821 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab1AP62821 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab1AP62821 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab1AP62821 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab1AP62821 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab1AP62821 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab1AP62821 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab1AP62821 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab1AP62821 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab1AP62821 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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