Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp46P62069 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Usp46P62069 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Usp46P62069 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp46P62069 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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Usp46P62069 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp46P62069 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Usp46P62069 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Usp46P62069 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Usp46P62069 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp46P62069 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp46P62069 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp46P62069 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp46P62069 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms