Protein–RNA interactions for Protein: P61807

Snn, Stannin, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnnP61807 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SnnP61807 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SnnP61807 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SnnP61807 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SnnP61807 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SnnP61807 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SnnP61807 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SnnP61807 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SnnP61807 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SnnP61807 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SnnP61807 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SnnP61807 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SnnP61807 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SnnP61807 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SnnP61807 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SnnP61807 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SnnP61807 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SnnP61807 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SnnP61807 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SnnP61807 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SnnP61807 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SnnP61807 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SnnP61807 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SnnP61807 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SnnP61807 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SnnP61807 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SnnP61807 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SnnP61807 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SnnP61807 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SnnP61807 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SnnP61807 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SnnP61807 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SnnP61807 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SnnP61807 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SnnP61807 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SnnP61807 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SnnP61807 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SnnP61807 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SnnP61807 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SnnP61807 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SnnP61807 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SnnP61807 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SnnP61807 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SnnP61807 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SnnP61807 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SnnP61807 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SnnP61807 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SnnP61807 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SnnP61807 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SnnP61807 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SnnP61807 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SnnP61807 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SnnP61807 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SnnP61807 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SnnP61807 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SnnP61807 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SnnP61807 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SnnP61807 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SnnP61807 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SnnP61807 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SnnP61807 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SnnP61807 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SnnP61807 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SnnP61807 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SnnP61807 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SnnP61807 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SnnP61807 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SnnP61807 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SnnP61807 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SnnP61807 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SnnP61807 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SnnP61807 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SnnP61807 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SnnP61807 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SnnP61807 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SnnP61807 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SnnP61807 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SnnP61807 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SnnP61807 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SnnP61807 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SnnP61807 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SnnP61807 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SnnP61807 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SnnP61807 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SnnP61807 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SnnP61807 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SnnP61807 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SnnP61807 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SnnP61807 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SnnP61807 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SnnP61807 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SnnP61807 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SnnP61807 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SnnP61807 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SnnP61807 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SnnP61807 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SnnP61807 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SnnP61807 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SnnP61807 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SnnP61807 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms