Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms