Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms