Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Setd4P58467 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Setd4P58467 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Setd4P58467 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Setd4P58467 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Setd4P58467 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Setd4P58467 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Setd4P58467 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms