Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms