Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TdgP56581 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TdgP56581 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TdgP56581 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TdgP56581 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TdgP56581 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TdgP56581 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TdgP56581 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TdgP56581 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TdgP56581 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TdgP56581 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TdgP56581 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TdgP56581 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TdgP56581 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TdgP56581 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TdgP56581 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TdgP56581 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TdgP56581 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TdgP56581 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TdgP56581 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TdgP56581 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TdgP56581 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TdgP56581 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TdgP56581 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TdgP56581 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TdgP56581 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TdgP56581 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TdgP56581 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TdgP56581 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TdgP56581 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TdgP56581 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TdgP56581 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TdgP56581 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TdgP56581 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TdgP56581 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TdgP56581 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TdgP56581 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TdgP56581 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TdgP56581 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TdgP56581 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TdgP56581 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TdgP56581 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TdgP56581 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TdgP56581 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TdgP56581 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TdgP56581 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TdgP56581 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TdgP56581 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TdgP56581 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TdgP56581 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TdgP56581 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TdgP56581 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TdgP56581 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TdgP56581 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TdgP56581 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TdgP56581 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TdgP56581 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TdgP56581 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TdgP56581 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TdgP56581 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TdgP56581 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TdgP56581 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TdgP56581 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TdgP56581 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TdgP56581 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TdgP56581 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TdgP56581 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TdgP56581 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TdgP56581 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TdgP56581 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TdgP56581 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TdgP56581 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TdgP56581 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TdgP56581 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TdgP56581 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TdgP56581 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TdgP56581 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TdgP56581 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TdgP56581 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TdgP56581 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TdgP56581 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TdgP56581 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TdgP56581 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TdgP56581 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TdgP56581 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TdgP56581 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TdgP56581 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TdgP56581 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TdgP56581 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TdgP56581 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TdgP56581 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TdgP56581 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TdgP56581 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TdgP56581 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TdgP56581 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TdgP56581 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TdgP56581 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TdgP56581 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TdgP56581 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TdgP56581 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms