Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5bP56480 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5bP56480 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5bP56480 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5bP56480 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5bP56480 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5bP56480 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5bP56480 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5bP56480 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5bP56480 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp5bP56480 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp5bP56480 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp5bP56480 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp5bP56480 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms