Protein–RNA interactions for Protein: P56450

Mc4r, Melanocortin receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc4rP56450 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Mc4rP56450 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc4rP56450 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms