Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CartptP56388 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CartptP56388 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CartptP56388 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CartptP56388 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CartptP56388 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CartptP56388 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CartptP56388 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CartptP56388 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
CartptP56388 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CartptP56388 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CartptP56388 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CartptP56388 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CartptP56388 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CartptP56388 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CartptP56388 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CartptP56388 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CartptP56388 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CartptP56388 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CartptP56388 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CartptP56388 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CartptP56388 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CartptP56388 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CartptP56388 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CartptP56388 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CartptP56388 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CartptP56388 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CartptP56388 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CartptP56388 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CartptP56388 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CartptP56388 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CartptP56388 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CartptP56388 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CartptP56388 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CartptP56388 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CartptP56388 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CartptP56388 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CartptP56388 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CartptP56388 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CartptP56388 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CartptP56388 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CartptP56388 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CartptP56388 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CartptP56388 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CartptP56388 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CartptP56388 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CartptP56388 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CartptP56388 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CartptP56388 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CartptP56388 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CartptP56388 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CartptP56388 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CartptP56388 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CartptP56388 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CartptP56388 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CartptP56388 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CartptP56388 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CartptP56388 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CartptP56388 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CartptP56388 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CartptP56388 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CartptP56388 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CartptP56388 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CartptP56388 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CartptP56388 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CartptP56388 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CartptP56388 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CartptP56388 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CartptP56388 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CartptP56388 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CartptP56388 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CartptP56388 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CartptP56388 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CartptP56388 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CartptP56388 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CartptP56388 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CartptP56388 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CartptP56388 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CartptP56388 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CartptP56388 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CartptP56388 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CartptP56388 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CartptP56388 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CartptP56388 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CartptP56388 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CartptP56388 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CartptP56388 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CartptP56388 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CartptP56388 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CartptP56388 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CartptP56388 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CartptP56388 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CartptP56388 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CartptP56388 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CartptP56388 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CartptP56388 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CartptP56388 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CartptP56388 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CartptP56388 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CartptP56388 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms