Protein–RNA interactions for Protein: P54227

Stmn1, Stathmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stmn1P54227 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stmn1P54227 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stmn1P54227 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stmn1P54227 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stmn1P54227 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Stmn1P54227 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stmn1P54227 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stmn1P54227 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stmn1P54227 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stmn1P54227 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmn1P54227 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmn1P54227 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmn1P54227 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmn1P54227 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmn1P54227 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmn1P54227 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmn1P54227 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmn1P54227 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmn1P54227 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmn1P54227 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmn1P54227 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmn1P54227 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmn1P54227 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmn1P54227 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmn1P54227 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmn1P54227 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmn1P54227 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmn1P54227 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmn1P54227 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmn1P54227 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmn1P54227 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmn1P54227 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmn1P54227 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmn1P54227 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmn1P54227 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmn1P54227 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmn1P54227 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmn1P54227 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmn1P54227 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmn1P54227 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmn1P54227 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmn1P54227 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmn1P54227 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmn1P54227 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stmn1P54227 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stmn1P54227 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stmn1P54227 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stmn1P54227 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stmn1P54227 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stmn1P54227 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stmn1P54227 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stmn1P54227 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stmn1P54227 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stmn1P54227 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stmn1P54227 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stmn1P54227 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stmn1P54227 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stmn1P54227 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stmn1P54227 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stmn1P54227 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stmn1P54227 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stmn1P54227 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stmn1P54227 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Stmn1P54227 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stmn1P54227 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stmn1P54227 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stmn1P54227 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stmn1P54227 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stmn1P54227 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stmn1P54227 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stmn1P54227 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stmn1P54227 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stmn1P54227 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stmn1P54227 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stmn1P54227 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stmn1P54227 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stmn1P54227 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Stmn1P54227 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stmn1P54227 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stmn1P54227 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stmn1P54227 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stmn1P54227 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stmn1P54227 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stmn1P54227 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stmn1P54227 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stmn1P54227 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stmn1P54227 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stmn1P54227 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stmn1P54227 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stmn1P54227 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stmn1P54227 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stmn1P54227 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stmn1P54227 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stmn1P54227 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Stmn1P54227 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stmn1P54227 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stmn1P54227 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stmn1P54227 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stmn1P54227 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stmn1P54227 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms