Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClgnP52194 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClgnP52194 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClgnP52194 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClgnP52194 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClgnP52194 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClgnP52194 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClgnP52194 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms