Protein–RNA interactions for Protein: P51827

Aff3, AF4/FMR2 family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff3P51827 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aff3P51827 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aff3P51827 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff3P51827 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Aff3P51827 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aff3P51827 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aff3P51827 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aff3P51827 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aff3P51827 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aff3P51827 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Aff3P51827 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aff3P51827 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aff3P51827 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Aff3P51827 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aff3P51827 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aff3P51827 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aff3P51827 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aff3P51827 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aff3P51827 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aff3P51827 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aff3P51827 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aff3P51827 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aff3P51827 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Aff3P51827 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aff3P51827 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aff3P51827 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aff3P51827 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aff3P51827 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms