Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms