Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gpc4P51655 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms