Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa6P50704 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa6P50704 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa6P50704 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa6P50704 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa6P50704 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Defa6P50704 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa6P50704 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa6P50704 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa6P50704 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa6P50704 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms