Protein–RNA interactions for Protein: P50481

Lhx3, LIM/homeobox protein Lhx3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx3P50481 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx3P50481 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx3P50481 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx3P50481 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx3P50481 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lhx3P50481 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx3P50481 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx3P50481 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx3P50481 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lhx3P50481 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lhx3P50481 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx3P50481 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx3P50481 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx3P50481 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx3P50481 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx3P50481 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx3P50481 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx3P50481 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx3P50481 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx3P50481 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx3P50481 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx3P50481 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lhx3P50481 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lhx3P50481 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lhx3P50481 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lhx3P50481 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lhx3P50481 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lhx3P50481 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lhx3P50481 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Lhx3P50481 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Lhx3P50481 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx3P50481 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx3P50481 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx3P50481 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx3P50481 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx3P50481 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx3P50481 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx3P50481 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lhx3P50481 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx3P50481 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lhx3P50481 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lhx3P50481 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx3P50481 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx3P50481 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx3P50481 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lhx3P50481 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx3P50481 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lhx3P50481 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx3P50481 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx3P50481 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx3P50481 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx3P50481 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx3P50481 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx3P50481 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx3P50481 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx3P50481 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx3P50481 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx3P50481 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx3P50481 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx3P50481 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx3P50481 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx3P50481 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx3P50481 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx3P50481 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx3P50481 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx3P50481 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx3P50481 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx3P50481 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx3P50481 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx3P50481 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx3P50481 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx3P50481 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lhx3P50481 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx3P50481 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx3P50481 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx3P50481 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx3P50481 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx3P50481 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx3P50481 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx3P50481 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx3P50481 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx3P50481 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lhx3P50481 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx3P50481 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx3P50481 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx3P50481 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lhx3P50481 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lhx3P50481 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lhx3P50481 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Lhx3P50481 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lhx3P50481 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lhx3P50481 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lhx3P50481 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lhx3P50481 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lhx3P50481 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lhx3P50481 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lhx3P50481 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lhx3P50481 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lhx3P50481 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lhx3P50481 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms